ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Prediction of the disulphide bonding state of cysteines in proteins using Conditional Random Fields

หน่วยงาน มหาวิทยาลัยเชียงใหม่

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Prediction of the disulphide bonding state of cysteines in proteins using Conditional Random Fields
นักวิจัย : Shoombuatong W. , Traisathit P. , Prasitwattanaseree S. , Tayapiwatana C. , Cutler R. , Chaijaruwanich J.
คำค้น : -
หน่วยงาน : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2554
อ้างอิง : 17485673 , 2-s2.0-79960970337 , 10.1504/IJDMB.2011.041559 , https://www.scopus.com/inward/record.uri?partnerID=HzOxMe3b&scp=79960970337&origin=inward , http://cmuir.cmu.ac.th/jspui/handle/6653943832/43037
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

The formation of disulphide bonds between cysteines plays a major role in protein folding, structure, function and evolution. Many computational approaches have been used to predict the disulphide bonding state of cysteines. In our work, we developed a novel method based on Conditional Random Fields (CRFs) to predict the disulphide bonding state from protein primary sequence, predicted secondary structures and predicted relative solvent accessibilities (all-state information). Our experiments obtain 84% accuracy, 88% precision and 94% recall, using all-state information. However, our results show essentially identical results when using protein sequence and predicted relative solvent accessibilities in the absence of secondary structure. © 2011 Inderscience Enterprises Ltd.

บรรณานุกรม :
Shoombuatong W. , Traisathit P. , Prasitwattanaseree S. , Tayapiwatana C. , Cutler R. , Chaijaruwanich J. . (2554). Prediction of the disulphide bonding state of cysteines in proteins using Conditional Random Fields.
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Shoombuatong W. , Traisathit P. , Prasitwattanaseree S. , Tayapiwatana C. , Cutler R. , Chaijaruwanich J. . 2554. "Prediction of the disulphide bonding state of cysteines in proteins using Conditional Random Fields".
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Shoombuatong W. , Traisathit P. , Prasitwattanaseree S. , Tayapiwatana C. , Cutler R. , Chaijaruwanich J. . "Prediction of the disulphide bonding state of cysteines in proteins using Conditional Random Fields."
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ , 2554. Print.
Shoombuatong W. , Traisathit P. , Prasitwattanaseree S. , Tayapiwatana C. , Cutler R. , Chaijaruwanich J. . Prediction of the disulphide bonding state of cysteines in proteins using Conditional Random Fields. เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ; 2554.