Keanekaragaman dan kelimpahan ikan di Perairan Danau Toba Balige serta keterkaitannya dengan kualitas Perairan di Danau Toba Balige, telah diteliti pada bulan Desember 2008 . Februari 2009. Metode yang digunakan dalam menentukan lokasi pengambilan sampel adalah .Purpose Random Sampling. dan sampel diambil dengan menggunakan jaring. Identifikasi sampel dilakukan di Puslitdal dan di Laboratorium PSDAL FMIPA USU. Hasil penelitian menunjukkan sifat fisika kimia dan biologi Perairan Danau Toba Balige (Temperatur, pH, BOD, COD, DO dan Coliform, masih berada dalam batas yang layak bagi kehidupan ikan kecuali NO3 dan pHs, sedangkan berdasarkan PP No. 82 Tahun 2001 dan Metode Storet. Perairan Danau Toba Balige tergolong tercemar ringan dan sedang. Berdasarkan parameter biologis Colifecal Perairan Danau Toba Balige tergolong tercemar ringan. Di Perairan Danau Toba Balige ditemukan 1 kelas ikan yaitu kelas Osteicthyes dengan 3 ordo antara lain Cypriniformes, Perciformes, Ostariophysii dan 5 family yaitu Cyprinidae, Chichilidae, Eleotridae, Claridae, Cebitidae serta 7 genus dan 7 spesies yang meliputi Cyprinus Carpio, Mystacoleucus padangensis, Tilapia mossambica, Oreochromis sp, Opheocephalus striatus, Oxyeleotris marmorata dan Clarias batracus. Kepadatan ikan tertinggi dari jenis ikan Pora-pora (Mystacoleucus padangensis) 0,116 per m2 sedangkan yang terendah adalah ikan Gabus (Opheocephalus striatus) dengan nilai 0,003 per m2. Jenis ikan dengan frekuensi kehadiran tertinggi ikan Pora-pora (Mystacoleucus padangensis) sebesar 100% sedangkan terendah adalah Oreochromis sp, sebesar 33,33%. Indeks keanekaragaman ikan pada keempat stasiun penelitian berkisar antara 1,12 . 1,37 dengan keseragaman 0,63 . 0,70. Indeks similaritas antara keempat stasiun berkisar antara 83,33% . 100%. Hasil uji korelasi Pearson menunjukkan bahwa temperatur, BOD5,, Nitrat, Fosfat dan Coliform berkorelasi searah terhadap keanekaragaman dan kelimpahan ikan Perairan Danau Toba Balige, DO, pH, COD dan kejenuhan, berkorelasi berlawanan arah terhadap keanekaragaman dan kelimpahan ikan di Perairan Danau Toba Balige.

09E02214