ปัญหาบางประเภทเช่นการค้นหาฐานข้อมูลภาพด้วยภาพหรือฐานข้อมูลวัตถุด้วยบางส่วนของวัตถุ การทำ optical character recognition, การสร้างรูปสามมิติจาก sensor ต่างๆ, การหาเป้าหมายการทำงานของยา (drug target) การระบุหน้าที่การทำงานของโปรตีน, การทำ whole genome sequencing หรือแม้กระทั่งเกมส์การต่อ jigsaw เป็นต้น ปัญหาดังกล่าวนั้นมีส่วนประกอบที่สำคัญร่วมกันอยู่คือ การคำนวณหาโครงสร้างร่วมกันหรือที่ซ้ำเหลื่อมกัน (isomorphic substructure matching) แม้จะเป็นที่ต้องการอย่างมากในหลายๆ การประยุกต์ใช้ แต่ปัจจุบันการคำนวณดังกล่าวยังไม่มีวิธีใดที่เป็นที่ยอมรับว่าใช้งานได้อย่างมีประสิทธิภาพพอที่จะรับกับข้อมูลปริมาณมาก และการแก้ปัญหาจะเฉพาะเจาะจงกับปัญหาใดปัญหาหนึ่งเท่านั้นไม่สามารถนำไปประยุกต์ใช้กับปัญหาอื่นได้ โครงการนี้จึงต้องการจะศึกษาวิธีการที่มีที่มาจากหลายๆ สาขาวิชาทั้งทางด้าน graph algorithms, computational genometry, statistical pattern recognition , social science และ biological evolution เพื่อความเข้าใจและสามารถสร้างกระบวนวิธีใหม่ในการแก้ปัญหาและนำไปใช้ได้จริงในรูปแบบของซอฟต์แวร์