เก็บตัวอย่างมะเขือเทศที่แสดงอาการต้นแคระแกร็น ยอดหงิก ใบม้วนลง ใบม้วนขึ้นใบด่างเหลือง เส้นใบเขียว ขอบใบ และหลังใบมีสีม่วง ขอบใบไหม้ จากพื้นที่จังหวัดต่าง ๆ มาเพื่อแยกเชื้อและจำแนกชนิดไวรอยด์ที่เป็นสาเหตุโรค สกัดกรดนิวคลีอิคชนิดอาร์เอ็นเอจากใบมะเขือเทศที่เก็บจากจังหวัดนครปฐม กาญจนบุรี และเชียงใหม่ แล้วปลูกเชื้อลงบนพืชทดสอบ พบว่า มะเขือเทศพันธุ์สีดาแสดงอาการโรค 2 ลักษณะ คือ อาการไม่รุนแรงเช่น ใบม้วนลง ใบด่าง ใบหงิกย่น และอาการรุนแรง เช่น ยอดหงิก ลำต้น กิ่งก้าน และใบไหม้ สำหรับพริกพันธุ์ CA363 แสดงอาการไหม้ที่ลำต้น กิ่งก้านและ ใบ ส่วนแตงกวาพันธุ์การค้า และ ~iGynura aurantiaca~i D.C. ไม่แสดงอาการของโรคอาร์เอ็นเอที่ทำให้เกิดโรคไม่รุนแรง (KB1) และรุนแรง (KB5) บนมะเขือเทศพันธุ์สีดาถูกนำมาเพิ่มปริมาณด้วยเทคนิค Reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR) ด้วยไพรเมอร์ที่มีความจำเพาะเจาะจงต่อเชื้อ potato spindle tuber viroid(PSTVd) ได้ดีเอ็นเอขนาด 305 (KB1) และ 302 (KB5) นิวคลีโอไทด์ มีความเหมือนกัน98 เปอร์เซ็นต์ และเมื่อนำลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ทำให้เกิดโรครุนแรงบนมะเขือเทศพันธุ์สีดา(KB5) ไปเปรียบเทียบกับเชื้อ PSTVd ไอโซเลทต่าง ๆ และเชื้อไวรอยด์ในกลุ่ม~iPospiviroidae~i โดยใช้โปรแกรม DNASIS version 3.0 พบว่ามีความเหมือนของลำดับนิวคลีโอไทด์ 51 และ 52 เปอร์เซ็นต์ตามลำดับ นอกจากนี้ยังพบว่าลำดับนิวคลีโอไทด์ตำแหน่งที่ 1-19 และ 287-302 มีความเหมือนกับลำดับนิวคลีโอไทด์ในส่วน C domainตำแหน่งที่ 81-115 ของเชื้อ PSTVd (Schnoelzer ~iet al~i., 1985) แต่เนื่องจากเปอร์เซ็นต์ความเหมือนกับเชื้อไวรอยด์ต่ำจึงยังไม่สามารถจัดให้เป็นไวรอยด์ชนิดใดได้ การตรวจสอบอาร์เอ็นเอของเชื้อไวรอยด์ด้วยเทคนิค sPAGE ไม่พบแถบอาร์เอ็นเอจากตัวอย่างมะเขือเทศที่สุ่มเก็บมาจากจังหวัดต่างๆ แต่พบแถบอาร์เอ็นเอบน denaturinggel จากตัวอย่างมะเขือเทศพันธุ์สีดา และพริกพันธุ์ CA363 ที่ได้รับการปลูกเชื้อและแสดงอาการโรค ดีเอ็นเอตัวตรวจ (cDNA probe) ที่สังเคราะห์ได้จากโคลน KB5/44สามารถตรวจสอบตัวอย่างมะเขือเทศที่เก็บจากจังหวัดนครปฐม กาญจนบุรี เชียงรายที่ทำให้มะเขือเทศพันธุ์สีดา และพริกพันธุ์ CA363 ที่ได้รับการปลูกเชื้อแสดงอาการโรคโดยมีความจำเพาะเจาะจง (specific) ต่อแถบดีเอ็นเอขนาดประมาณ 300 นิวคลีโอไทด์ที่ได้จากการเพิ่มปริมาณเทคนิค RT-PCR ด้วยไพรเมอร์ที่มีความจำเพาะเจาะจงกับเชื้อ PSTVd เนื่องจากในการทดลองครั้งนี้ใช้อาร์เอ็นเอที่สกัดได้ทั้งหมดปลูกเชื้อให้กับมะเขือเทศพันธุ์สีดาจึงคาดว่าอาร์เอ็นเอที่สกัดได้จากตัวอย่างจากจังหวัดนครปฐมกาญจนบุรี และเชียงใหม่ สามารถทำให้มะเขือเทศพันธุ์สีดา และพริกพันธุ์ CA363 เกิดโรค