ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การสร้างแผนที่จีโนมของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomallei~i โดยวิธีฟลูออเรสเซ็นต์ ฟิงเกอร์ปลิ้นติ้ง

หน่วยงาน ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การสร้างแผนที่จีโนมของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomallei~i โดยวิธีฟลูออเรสเซ็นต์ ฟิงเกอร์ปลิ้นติ้ง
นักวิจัย : พลสิทธิ์ ชะมด
คำค้น : ~iBurkholderia pseudomallei~i , GENOME. , PHYSICAL MAP , CONTIG MAP , FLUORESCENT FINGERPRINTING
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2544
อ้างอิง : http://www.thaithesis.org/detail.php?id=45751
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

~iBurkholderia pseudomallei~i เป็นแบคทีเรียประเภท gram-negative ซึ่งเป็น สาเหตุของโรค melioidosis, ในหลายประเทศของโลก โรคนี้เป็นสาเหตุที่สำคัญของการ เสียชีวิตของประชากรที่ได้รับการติดเชื้อ โรคนี้มีการระบาดในเอเซียตะวันออกเฉียงใต้ และทางตอนเหนือของทวีปออสเตรเลีย โดยในประเทศไทยพบว่ามีปัญหาการระบาดอย่างมากใน ภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย การศึกษารหัสพันธุกรรมของเชื้อแบคทีเรีย ~iBurkholderia pseudomalliei~i จะสามารถนำไปสู่ความเข้าใจลักษณะของเชื้อสายพันธุ์ นี้ได้ดีขึ้น รวมถึง การพัฒนาการรักษา และยารักษาด้วย โครงการวิจัยนี้เป็นการจัดทำ แผนที่ทางกายภาพของจีโนมของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomallei~i (สายพันธุ์ที่ไม่ สามารถดูดซึม อะราบิโนส) สายพันธุ์ K96243 โดยอาศัยวิธีการทาง ฟลูออเรสเซ็นต์ ฟิงเกอร์ปลิ้นติ้งกับสมาชิกของกลุ่มคอสมิก-ดีเอ็นเอในห้องสมุดจีโนมของเชื้อนี้จำนวน 2,122 โคลน วิธีการนี้เป็นการใช้สารเรืองแสง 3 ชนิดที่มีช่วงดูดกลืนแสงที่แตกต่างกัน สังเคราะห์ติดกับสารไดคีออกซี-เอทีพี เพื่อติดฉลากกับด้านปลายของสายดีเอ็นเอที่จำเพาะ ต่อเอนไซม์ตัดจำเพาะ ~iHin~idIII จากสายดีเอ็นเอจากโคลนแบคทีเรีย ซึ่งถูกตัดโดย เอนไซม์ตัดจำเพาะ ~iHin~idIII และ ~iSau~i3AI ต่อจากนั้นแถบดีเอ็นเอที่ได้จะถูกนำ ไปแยกโดยวิธีการ อาศัยกระแสไฟฟ้า ผลการทดลองถูกนำไปการประมวลผลด้วยโปรแกรมคอมพิวเตอร์ โดยใช้โปรแกรม FPC ในการสร้างแผนที่ทางกายภาพของจีโนม เปอร์เซ็นต์ในการคัดเลือกโคลน แบคทีเรียมาใช้ในการสร้างแผนที่ ทางกายภาพของจีโนมเท่ากับ 77.99% หรือ 1,655 โคลน จาก 2,122 โคลนโดยค่าเฉลี่ยของจำนวนแถบดีเอ็นเอ ในการแยกด้วยกระแสไฟฟ้าต่อหนึ่งโคลน คือ 14.9 แถบ ด้วยลักษณะดังกล่าวนี้แผนที่กายภาพของจีโนม เพียงหนึ่งเดียวถูกสร้างขึ้น โดยมีขนาดครอบคลุม 5,691 กิโลเบส หรือประมาณ 87.02 เปอร์เซ็นต์ของขนาดจีโนมทั้งหมด คือ 6.54 เมกกาเบสของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomalliei.~i

บรรณานุกรม :
พลสิทธิ์ ชะมด . (2544). การสร้างแผนที่จีโนมของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomallei~i โดยวิธีฟลูออเรสเซ็นต์ ฟิงเกอร์ปลิ้นติ้ง.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
พลสิทธิ์ ชะมด . 2544. "การสร้างแผนที่จีโนมของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomallei~i โดยวิธีฟลูออเรสเซ็นต์ ฟิงเกอร์ปลิ้นติ้ง".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
พลสิทธิ์ ชะมด . "การสร้างแผนที่จีโนมของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomallei~i โดยวิธีฟลูออเรสเซ็นต์ ฟิงเกอร์ปลิ้นติ้ง."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2544. Print.
พลสิทธิ์ ชะมด . การสร้างแผนที่จีโนมของเชื้อ ~iBurkholderia pseudomallei~i โดยวิธีฟลูออเรสเซ็นต์ ฟิงเกอร์ปลิ้นติ้ง. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2544.