คลอโรควีนเป็นยาที่มีความสำคัญในการรักษา และป้องกันโรคมาลาเรียมาเป็นเวลานาน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ต่อเชื้อ พลาสโมเดียม ฟาลซิพารัม เพราะเป็นยาที่ใช้ง่าย ไม่มีหรือมีผลข้างเคียงน้อยมาก และมีราคาถูก ปัจจุบันนี้ เป็นที่น่าเสียดายที่เชื้อพลาสโมเดียม ฟาลซิพารัม ดื้อ ต่อยานี้ และไม่สามารถใช้ยานี้ได้ในบางพื้นที่ของโลก เนื่องจากเชื้อมีความต้านทานต่อยาสูง กลไกการดื้อต่อยา คลอโรควีนของเชื้อ พลาสโมเดียม ฟาลซิพารัม ยังไม่ทราบ แน่ชัด ได้มีงานวิจัยหลายชิ้นพยายามหาคำอธิบายสำหรับ ปรากฎการณ์นั้น หนึ่งในสมมติฐานที่น่าสนใจคือ การที่ พบว่ายาถูกขับออกมาจากเซลล์พาราไซต์ด้วยความเร็ว มากกว่าในสภาวะที่เชื้อไม่ดื้อต่อยา 40-50 เท่า โดย ผ่านปั๊มอันหนึ่งซึ่งทำงานขึ้นอยู่กับ ATP การศึกษาครั้งนี้ สนใจเอ็นไซม์ไซโตโครมออกซิเดส หน่วยย่อยที่ 3 ซึ่ง ถอดรหัสมาจากยีนในไมโตคอนเดรีย ซึ่งเอนไซม์นี้เป็นส่วน ประกอบที่สำคัญตัวหนึ่งในขบวนการขนส่งอิเลคตรอน โดยศึกษาลำดับของโปรตีน และยีนที่ถอดรหัสให้โปรตีนนี้ ในเชื้อพลาสโมเดียม ฟาลซิพารัม ที่ดื้อต่อยาคลอโรควีน เทียบกับเชื้อที่ไวต่อยาคลอโรควีน โดยการเพิ่มปริมาณ ยีนนี้โดยวิธี PCR หลังจากนั้นโคลนยีนนี้เข้าในพลาสมิด pUC 18 แล้วนำไปหาลำดับเบสโดยวิธี Dideoxy Chain Termination ของ Sanger ผลจากการหาลำดับเบส พบว่ามีเบสเปลี่ยนไป 2 ตำแหน่งคือ T771C และ A1484G ที่ตำแหน่ง 771 การเปลี่ยนแปลงของเบสมีผลทำให้กรด อะมิโนเปลี่ยนจาก isoleucine เป็น valine เมื่อ พิจารณาดูแล้ว ถึงแม้ตำแหน่งนี้จะเป็น highly conserved residue แต่กรดอะมิโนที่มาแทนกันเป็นกลุ่มเดียวกัน มีคุณสมบัติคล้ายกัน การเปลี่ยนแปลงนี้จึงไม่น่าจะมีผล ต่อการทำงานของโปรตีนนัก อีกตำแหน่งหนึ่งที่พบการ เปลี่ยนแปลงของลำดับเบส คือ 1484 การเปลี่ยนแปลง ของเบสมีผลทำให้กรดอะมิโนเปลี่ยนจาก phenylalanine เป็น serine เมื่อพิจารณาดูแล้ว ถึงแม้กรดอะมิโน 2 ตัวนี้จะมีคุณสมบัติทางเคมีแตกต่างกัน แต่เมื่อแทน ที่กันในตำแหน่งที่เป็น hypervariable region ซึ่ง ไม่มีหน้าที่สำคัญ การเปลี่ยนแปลงนี้จึงไม่น่าจะมีผลต่อ การทำงานของโปรตีน ประกอบกับผลของการทำนาย ลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ไม่เปลี่ยนแปลงเมื่อแทนที่ ด้วยกรดอะมิโนที่เปลี่ยนไป จึงอาจสรุปได้ว่าเอนไซม์ ไซโตโครมออกซิเดส หน่วยย่อยที่ 3 และยีนที่ถอดรหัส ให้เอนไซม์ตัวนี้อาจจะไม่มีความสัมพันธ์กับกลไกการ ดื้อต่อยาคลอโรควีนของเชื้อพลาสโมเดียม ฟาลซิพารัม ที่พบในประเทศไทย