จากการศึกษาความชุกชุม และความหลากหลายของสัตว์ หน้าดินในแม่น้ำเจ้าพระยาจาก 14 จุดสำรวจใน 8 จังหวัด ตั้งแต่เดือนมกราคม ถึงเดือนธันวาคม 2540 พบว่ามีสัตว์หน้าดิน ทั้งหมด 4 ไฟลัม ได้แก่ Annelida, Mollusca, Arthropoda และ Chordata ซึ่งจำแนกได้ 46 ครอบครัว โดยมีจำนวนชนิด ครอบครัวของสัตว์หน้าดินสูงสุดจำนวน 24 ครอบครัวที่บริเวณปาก แม่น้ำ และจำนวนชนิดครอบครัวของสัตว์หน้าดินน้อยที่สุดจำนวน 5 ครอบครัว ที่ อ.เมือง จ.สิงห์บุรี ในจุดสำรวจที่ 12 บริเวณ เขตพระโขนง พบปริมาณสัตว์หน้าดินสูงสุด คือ 6,736 ตัวต่อ ตารางเมตร และในจุดสำรวจที่ 3 บริเวณ อ.เมือง จ.สิงห์บุรี พบปริมาณสัตว์หน้าดินต่ำสุด คือ 66 ตัวต่อตารางเมตร โดยมี ปริมาณเฉลี่ยในทุกจุดสำรวจเท่ากับ 1,441 ตัวต่อตารางเมตร สัตว์หน้าดินที่เป็นชนิดเด่น คือ กลุ่ม Annelida โดยเฉพาะ ไส้เดือนน้ำจืดครอบครัว Naididae พบว่ามีปริมาณมากที่สุด ช่วงที่พบสัตว์หน้าดินมีปริมาณมากคือช่วงฤดูฝน โดยเฉพาะ เดือนกันยายนพบปริมาณสูงสุดในรอบปี ค่าดัชนีความหลากหลาย และค่าดัชนีความเท่าเทียมของสัตว์หน้าดินในจุดสำรวจที่ 4 บริเวณ อ.พระนครศรีอยุธยา มีค่าสูงสุดเท่ากับ 2.08 และ 0.79 ตามลำดับ ส่วนในจุดสำรวจที่ 12 บริเวณเขตพระโขนง มีค่าต่ำสุดเท่ากับ 0.12 และ 0.05 ตามลำดับ ซึ่งค่าดังกล่าว มีแนวโน้มที่นำมาใช้บ่งบอกคุณภาพน้ำร่วมกับปัจจัยสภาวะแวดล้อม อื่นๆ ได้ จากการศึกษาคุณภาพน้ำในแม่น้ำเจ้าพระยาพบว่า ค่าบีโอดีของน้ำในเขตพื้นที่แม่น้ำตอนบน ตอนกลาง และตอนล่าง มีค่าเกินมาตรฐานคุณภาพน้ำแหล่งน้ำผิวดินประเภทที่ 2, 3 และ 4 ตามลำดับ ขณะที่พารามิเตอร์อื่นๆ ส่วนใหญ่ยังมีค่าอยู่ในเกณฑ์ มาตรฐานคุณภาพน้ำแหล่งน้ำผิวดินทั้ง 3 ประเภท จากการ คำนวณค่าดัชนีคุณภาพน้ำทั่วไป (WQI) พบว่ามีค่าสูงกว่าความ เป็นจริง เนื่องจากมิได้นำค่าปริมาณแบคทีเรียกลุ่มฟีคัลโคลิฟอร์ม (FCB) มาคำนวณด้วย คุณภาพน้ำในเขตพื้นที่แม่น้ำตอนบนและตอน กลางจึงอยู่ในเกณฑ์ดีมากถึงพอใช้ แทนที่จะอยู่ในเกณฑ์พอใช้ถึงต่ำ ส่วนในเขตพื้นที่แม่น้ำตอนล่าง คุณภาพน้ำอยู่ในเกณฑ์ต่ำทุกจุดสำรวจ