จากการวิเคราะห์พันธุกรรมของพืชกลุ่มกระเจียวในระดับชนิด (species) และระดับโคลน (clone) โดยอาศัยเทคนิค Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) เพื่อตรวจสอบ ความสัมพันธ์ใกล้ชิดทางพันธุกรรมของกระเจียวจำนวน 10 ชนิด โดยใช้ไพรเมอร์ (Primer) ขนาด 10 นิวคลีโอไทด์ จำนวน 48 ไพรเมอร์ เพื่อเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอแบบสุ่ม พบว่ามี 3 ไพรเมอร์ คือ PA20, PD11 และ PAB04 ที่สามารถสังเคราะห์แถบดีเอ็นเอที่มีน้ำหนักโมเลกุลแตกต่างกัน ทั้งหมด 37 แถบ โดยมีน้ำหนักโมเลกุลประมาณ 200-1700 คู่เบส เมื่อวิเคราะห์ความแตกต่าง ระหว่างแถบดีเอ็นเอที่ได้จากลายพิมพ์ดีเอ็นเอ สามารถแบ่งกระเจียวที่ใช้ตรวจสอบ ออกเป็น 2 กลุ่ม โดยมีลักษณะสอดคล้องกับการจำแนกกลุ่มตามพฤติกรรมการออกดอกเร็วหรือช้า และสอดคล้องกับ การจำแนกกลุ่มด้วยเทคนิคไอโซไซม์ที่เคยมีรายงานมาแล้ว นอกจากนี้พบว่าในการวิเคราะห์ความแปรปรวนทางพันธุกรรมระดับโคลน (clonal variation) ของกระเจียว 3 ชนิด ได้แก่ MH (Curcuma sp.), CMUP (Curcuma petiolata Wall.) และ BC (Curcuma sp.) ชนิดละ 10 ตัวอย่าง โดยใช้ไพรเมอร์ PAB04 และ PAX17 พบว่า PAB04 สามารถแยกความแตกต่างทางพันธุกรรมระดับโคลนในกระเจียวทั้ง 3 ชนิดได้ ในขณะที่ PAX17 แยกได้เพียง 2 ชนิดคือ MH และ BC