ทำการตรวจหาแถบดีเอ็นเอที่ให้ความแตกต่างระหว่างกุ้งกุลาดำจากชายฝั่งทะเลอันดามัน และทะเลฝั่งอ่าวไทยด้วยเทคนิค Randomly Amplified PolymorphicDNA(RAPD) โดยการคัดเลือกเบสไม่จำเพาะทั้งสิ้น 11 ไพรเมอร์ ซึ่งมี 2 ไพรเมอร์คือ ไพรเมอร์ OPB 08 และ OPD15 ให้แถบดีเอ็นเอที่พบเฉพาะในกุ้งกุลาดำจากทะเลฝั่งอ่าวไทย กล่าวคือ ไพรเมอร์ OPD 08 ให้แถบดีเอ็นเอประมาณ 850 คู่เบสและไพรเมอร์ OPB 15 ให้แถบดีเอ็นเอขนาด 1,000 คู่เบส เมื่อเพิ่มจำนวนกุ้งกุลาดำทดสอบ 2 ไพรเมอร์นี้พบว่าทั้ง 2 ไพรเมอร์ สามารให้แถบดีเอ็นเอในกุ้งจากฝั่งอันดามันเช่นกัน ฉะนั้นจึงนำไพรเมอร์ 428 ที่มีรายงานมาก่อนว่าให้แถบดีเอ็นเอขนาดประมาณ950 คู่เบสที่พบเฉพาะในกุ้งที่มาจากทะเลอันดามัน คือ จากสตูล-ตรังเป็นเครื่องหมายในการจำแนกกลุ่มประชากรจากฝั่งทะเลอันดามันและอ่าวไทยต่อไป ทำการแยกชิ้นดีเอ็นเอ 950 คู่เบส นำไปโคลนเข้าพลาสมิด pUC 18 แล้วทรานฟอร์มเข้าสู่เซลล์แบคทีเรีย XL1-Blue พบโคลน 3 แบบ (คือโคลน A, B และ C)ที่ให้ขนาดชิ้นดีเอ็นเอ 900, 950 (เมื่อตัดด้วยเอนไซม์ Bam HI จะให้ดีเอ็นเอ 2ขนาด คือ 650 และ 350 คู่เบส) และ 350 คู่เบส ตามลำดับ และทำการตรวจสอบว่า ทั้ง 3 โคลนมาจากดีเอ็นเอขนาด 950 คู่เบส ที่แยกกุ้งทั้งสองฝั่งได้ โดยการทำSouthern Hybridization ด้วยดีเอ็นเอติดตามทั้ง 3 ขนาด (900, 650 และ 350คู่เบส) พบว่าดีเอ็นเอติดตามขนาด 900 คู่เบส ให้แถบดีเอ็นเอที่ปรากฏในกุ้งกุลาดำทั้ง 2 ฝั่ง ขณะที่เมื่อใช้ดีเอ็นเอขนาด 650 คู่เบส เป็นตัวติดตามจะให้แถบดีเอ็นเอเพียงแถบเดียวเฉพาะกุ้งกุลาดำจากฝั่งอันดามัน และเมื่อใช้ดีเอ็นเอขนาด 350 คู่เบสก็จะให้ผลเช่นกัน จากนั้นนำชิ้นดีเอ็นเอทั้ง 3 ขนาดไปหาลำดับนิวคลีโอไทด์และนำไปเปรียบเทียบกับยีนอื่น ๆ ที่มีรายงานไว้ใน GenBank ด้วยโปรแกรม BLAST พบว่าดีเอ็นเอขนาด 900 คู่เบส คล้ายกับยีน Asparagine Synthetase ส่วนดีเอ็นเอขนาด 950 และ 350 คู่เบส พบว่าไม่มีความคล้ายคลึงกับยีนใด ๆ จากลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ได้นำมาทำการออกแบบไพรเมอร์ เพื่อนำไปใช้เพิ่มปริมาณดีเอ็นเออย่างจำเพาะด้วยเทคนิคพีซีอาร์ แต่ไม่สามารถใช้แยกกุ้งจาก 2 ฝั่งทะเลได้ ดังนั้นวิธีที่จำเพาะในแยกความแตกต่างของกุ้งกุลาดำทั้งสองฝั่งได้ก็คือการนำเทคนิค Randomly Amplified Poymorphic DNA (RAPD) มาใช้คู่กับการทำSouthern Hybridization โดยใช้ดีเอ็นเอติดตามขนาด 650 และ 350 คู่เบสซึ่งให้แถบอีเอ็นเอเพียง 1 แถบ ขนาด 950 คู่เบส ซึ่งพบเฉพาะในกุ้งจากฝั่งอันดามัน