ความเข้มข้นของปรอทรีแอคทีฟที่ละลายน้ำ (Hg-R)(,D) ปรอทรวมละลายน้ำ(Hg-T)(,D) และปรอทแขวนลอย (Hg-P) ในเอสทูรีของแม่น้ำเจ้าพระยา มีค่าความเข้มข้นอยู่ในช่วง <0.15-5.23 ng/L, 2.16-18.1 ng/L และ 0.09-3.49 (+,m)g/g dry weight(10.2-112 ng/L) ตามลำดับ ค่าความเข้มข้นของปรอทดังกล่าวมีค่าเช่นเดียวกับที่พบในเอสทูรีอื่น ๆ การกระจายของปรอทในชั้นน้ำระหว่างฤดูแล้งและฤดูน้ำหลาก พบว่ามีความแตกต่างกันระหว่างฤดูกาล โดยปรอทรวมละลายน้ำในฤดูน้ำหลากมีค่าประมาณ 30% ของปริมาณปรอทรวมทั้งหมด (ปรอทที่ละลายน้ำ+ปรอทแขวนลอย) ขณะที่ในฤดูแล้งมีค่าเพียง 15% ของปรอทรวมทั้งหมด ปรอทที่ละลายน้ำส่วนใหญ่อยู่ในรูปปรอทที่ไม่รีแอคทีฟ (Hg-NR)(,D) ซึ่งมีจำนวนมากกว่า 85% ของปรอทรวมละลายน้ำ ชนิดของปรอทส่วนใหญ่ในเอสทูรี จะอยู่ในรูปของปรอทแขวนลอย (Hg-P) ซึ่งจะจับกับอนุภาคที่แขวนลอยถาวร โดยพบค่าสัมประสิทธิ์การแยกชั้น (K(,D)) ระหว่างปรอทแขวนลอยและปรอทที่ละลายน้ำมีค่าสูงในเขตที่น้ำมีความขุ่นสูงทั้งสองฤดู และพบค่า K(,D) ของฤดูแล้งสูงกว่าในฤดูน้ำหลาก ค่า K(,D) ของปรอทละลายน้ำที่ไม่รีแอคทีฟมีค่าสูงในฤดูแล้งแสดงว่าปรอทละลายน้ำที่ไม่รีแอคทีฟระหว่างฤดูแล้งกับฤดูน้ำหลากมีพฤติกรรมแตกต่างกันในเอสทูรีของแม่น้ำเจ้าพระยาพบว่า K(,D) มีค่าเพิ่มขึ้นตามความเค็มที่เพิ่มขึ้นด้วยเช่นกัน การทดลองในห้องปฏิบัติการแสดงให้เห็นว่า การดูดซับบนสารแขวนลอยและการคายออกของปรอทเกิดขึ้นได้ในระหว่างการผสมของน้ำแม่น้ำและน้ำทะเล การทดลองในห้องปฏิบัติการเพื่อศึกษาการละลายกลับของปรอทในตะกอนแสดงให้เห็นว่า ปรอทสามารถละลายออกมาจากตะกอนได้อย่างรวดเร็ว จากนั้นจะถูกดูดซับกลับไปยังตะกอนภายใน 6 ชั่วโมง ความเข้มข้นของปรอทที่ชั้นผิวของตะกอนมีความเข้มข้นในช่วง 0.2-0.77 (+,m)g/g(dry weight) ค่าความเข้มข้นของปรอทตามแนวดิ่งในท่อตะกอนแสดงให้เห็นว่า ความเข้มข้นของปรอทที่ชั้นผิวหน้า (ประมาณ 10 ซม แรก) มีค่าต่ำกว่าความเข้มข้นของปรอทเมื่อ20 ปีก่อน ถึง 3-5 เท่า ทั้งนี้เป็นผลเนื่องมาจากการใช้ปรอทในกระบวนการผลิตของอุตสาหกรรมบางประเภทในขณะนั้น