การศึกษาผลของคีโตโคนาโซลต่อหน้าที่ทางชีวพลังงานที่สำคัญของไมโตรคอนเดรียที่แยกจากตับหนูขาวพบว่าคีโตโคนาโซลมีผลทำให้อัตราการหายใจใน state 3 และ state 3uของไมโตคอนเดรียลดลงเมื่อใช้ NAD('+)-linked substrates(glutamate + malate, (...)-ketoglutarate, (...)-hydroxybutyrate และ pyruvate + malate) เป็นสัปสเตรทโดยคีโตโคนาโซลอาจจะออกฤทธิ์ยับยั้งการขนส่งอิเลคตรอนในลูกโซ่หายใจที่ complex I เป็นผลให้กระบวนการออกซิเดทีฟฟอสฟอริเลชั่น และความสามารถในการสังเคราห์ ATP ของไมโตคอนเดรียลดลง คีโตโคนาโซลมีแนวโน้มที่จะออกฤทธิ์ยับยั้งกระบวนการออกซิเดทีฟฟอสฟอริเลชั่นได้มากขึ้น เมื่อpH ของ incubation medium เป็นเบส ในขณะที่ bovine serumalbumin สามารถทำให้ฤทธิ์ของคีโตโคนาโซลลดลงได้อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ dithiothreitol ไม่มีผลในการเปลี่ยนแปลงฤทธิ์การยับยั้งกระบวนการหายใจของไมโตคอนเดรียโดยคีโตโคนาโซลคีโตโคนาโซลไม่มีผลต่อ ATPas acitivity การกระตุ้นการหายใจของไมโตคอนเดรียด้วยแคลเซียมถูกยับยั้งได้ด้วยคีโตโคนาโซล นอกจากนี้ คีโตโคนาโซลยังมีฤทธิ์ในการยับยั้งmonoamine oxidase ยังคงต้องทำการศึกษาต่อไปถึงผลของคีโตโคนาโซลต่อหน้าที่ทางชีวพลังงานของไมโตคอนเดรียดังกล่าวว่าเกี่ยวข้องหรือไม่กับฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาและ/หรือพิษวิทยาของตัวยานี้