เพื่อการตรวจหา Chlamydia trachomatis อย่างรวดเร็ว ด้วยวิธี Polymerase chain reaction (PCR) ได้ใช้ oligonucleotideprimers เพิ่มจำนวนชิ้นส่วนขนาด 621-bp ของ pCHL2 ซึ่งเป็น plasmidDNA ที่พบได้ใน C.trachomatis ทุกสายพันธุ์ ป้องกันการเกิดผลบวกปลอมเนื่องจาก amplicon carryover โดยใช้ dUTP แทน dTTP และเติม uracilDNA glycosylase (UDG) ลงในส่วนผสมของปฏิกิริยาตรวจหา amplifiedproduct บน agarose gel ซึ่งมี ethidium bromide ผสมอยู่ และพิสูจน์ยืนยันด้วย dot plot hobridization โดยใช้ 473-bp biotin-labelledprobe เป็นตัวติดตามจากผลการวิจัยพบว่าสามารถตรวจหา pCHL2 DNA ได้น้อยที่สุดเท่ากับ 2 fg ซึ่งเทียบเท่ากับ 243 copies ของ pCHL2 DNA ที่พบในC.trachomatis จำนวน 24 elementary body กลุ่มตัวอย่างที่ใช้ทดสอบประสิทธิภาพของ PCR ในการตรวจหา C.trachomatis จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วยคือ endocervical swab ของผู้ป่วยหญิงที่มารับการตรวจที่คลินิกโรคติดต่อทางเพศสัมพันธ์จำนวน 100 ราย นำมาตรวจหาC.trachomatis โดยใช้วิธี PCR และ cell culture ก่อนทำการทดสอบด้วยวิธีPCR นำสิ่งตรวจที่ได้รับมาปั่นตกตะกอน นำส่วนของตะกอนมาละลายใน lysis bufferซึ่งประกอบด้วย nonidet P-40, tween 20 และ proteinase K ที่อุณหภูมิ 60 ซ1 ชั่วโมง ต่อจากนั้นนำไปต้มนาน 10 นาที แบ่งตัวอย่างที่ได้จำนวน 5 ul มาทำPCR และเติม pCHL2 DNA ลงในตัวอย่างอีกส่วนหนึ่ง เป็น control เพื่อตรวจหาamplification inhibitor ในสิ่งส่งตรวจ เมื่อเปรียบเทียบผลการตรวจหา C. trachomatis จาก endocervical specimen จำนวน 100 ตัวอย่างโดยวิธีPCR กับ cell culture พบว่า PCR ให้ผลบวกกับสิ่งส่งตรวจทั้ง 12 ตัวอย่างที่ให้ผลบวกโดยวิธี cell culture และสามารถตรวจหาC. trachomatis ได้จากสิ่งส่งตรวจ 2 ใน 88 ตัวอย่างที่ให้ผลลบโดยวิธีcell culture เมื่อนำสิ่งส่งตรวจทั้งสองตัวอย่างที่ PCR ให้ผลบวกแต่cell culture ให้ผลลบ มาตรวจหา C. trachomatis โดยใช้ Gen-Probe Pace 2 system (Gen-Probe, Inc., San Diego, CA)พบว่าทั้งสองตัวอย่างให้ผลบวก ผลการทดลองดังกล่าวแสดงให้เห็นว่า PCRเป็นวิธีการตรวจหา C. trachomatis จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วยแบบรวดเร็ววิธีหนึ่งที่มีความไวและความจำเพาะสูง