ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การศึกษาผลของการดัดแปลงลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ปลาย 3(+,ข) ต่อเสถียรภาพ ของ mRNA ของยีน ~idesA~i จาก ~iSpirulina platensis~i strain C1

หน่วยงาน ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การศึกษาผลของการดัดแปลงลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ปลาย 3(+,ข) ต่อเสถียรภาพ ของ mRNA ของยีน ~idesA~i จาก ~iSpirulina platensis~i strain C1
นักวิจัย : สุทธิชา ณ ระนอง
คำค้น : ยีน ~idesA~i , RP sequence , โครงสร้างทุติยภูมิ , ความคงตัวของ mRNA , เอนไซม์ exoribonuclease , ~idesA~i GENE , RP SEQUENCE , SECONDARY STRUCTURE , mRNA STABILITY , EXORIBONUCLEASE ENZYME
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2544
อ้างอิง : http://www.thaithesis.org/detail.php?id=1430
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

วิทยานิพนธ์นี้เป็นการศึกษาผลของ repititive palindromic (RP) sequence และลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ปลาย 3(+,ข) ต่อเสถียรภาพาของ mRNA ของยีน ~idesA~i ((+,D)12 desaturase) ซึ่งเป็นหนึ่งในยีนที่เกี่ยวข้องในกระบวนการสร้างกรดแกมม่า ลิโนเลนิค (GLA) ของ ~iSpirulina platensis~i strain C1 เนื่องจากการศึกษาที่ ผ่านมาพบว่าปลาย 3(+,ข) ของ mRNA ของยีน ~idesA~i ของ ~iS. platensis~i strain C1 มีลำดับเบสที่เป็น RP sequence ที่สามารถเรียงตัวกันเป็นโครงสร้าง Stem loop อยู่ด้วยกันสามชุด ซึ่งลำดับเบสลักษณะเช่นนี้ไม่พบในยีน ~idesA~i ของไซยาโน แบคทีเรียชนิดอื่น นอกจากโครงสร้างที่เป็น RP sequence แล้วยังพบว่ามีลำดับเบส ที่สามารถเรียงตัวเป็น stem loop ได้อีกลำดับเบสนี้ให้ชื่อว่า AT rich sequence ซึ่งจะอยู่เหนือ RP sequence mRNA จากการศึกษาผลของ RP sequence และ AU rich Sequence ต่อเสถียรภาพของ mRNA ของยีน ~idesA~i โดยการทำนายโครงสร้างทุติยภูมิ ทางปลาย 3(+,ข) ของยีน ~idesA~i ด้วยโปรแกรม mfold พบว่าให้ผลที่สอดคล้องกับ วิธี ribonuclease assay ที่ทำในหลอดทดลอง โดยพบว่าโครงสร้าง hair-loop จาก ลำดับเบส AU rich ทำให้ ~idesA~i mRNA มีเสถียรภาพที่สุด โดยมี half-life มากกว่า 15 นาที ขณะที่ ~idesA~i ที่ไม่มีโครงสร้างทุติยภูมิทางปลาย 3(+,ข) มี half-life เพียง 8.8 นาที ส่วน mRNA ของยีน ~idesA~i ที่มีโครงสร้างที่ซับซ้อนของ RP Sequence ชุดที่หนึ่งและสอง สามารถเพิ่มความคงตัวให้กับ mRNA เพียงเล็กน้อย ประมาณ 1.7 และ 1.25 เท่า ตามลำดับเมื่อเปรียบเทียบกับ mRNA ของยีน ~idesA~i ที่ไม่มีโครงสร้างทุติยภูมิทางปลาย 3(+,ข) นอกจากนี้ยังพบว่าโครงสร้างทุติยภูมิ ที่มี RP sequence สามชุด เป็นโครงสร้างที่ซับซ้อนและอ่อนแอที่สุด โดยทำให้ half-life ของ mRNA ของยีน ~idesA~i ลดลงเหลือเพียง 3 นาที จากการศึกษานี้พบว่า โครงสร้างทุติยภูมิทางปลาย 3(+,ข) ของ mRNA ของยีน ~idesA~i นั้นมีส่วนช่วยเพิ่ม ความคงตัวให้กับ mRNA แต่ต้องอยู่ในลักษณะโครงสร้างที่เหมาะสม การมีโครงสร้าง ที่ซับซ้อนนอกจากจะไม่ช่วยเพิ่มเสถียรภาพให้กับ mRNA แล้วยังทำให้ความคงตัวของ mRNA ลดลงอีกด้วย จะเห็นได้ว่า RP sequence มีส่วนเกี่ยวข้องกับการควบคุมระดับ mRNA ของยีน ~idesA~i และจากการทำ Southern blot analysis พบว่า RP sequence ชุดนี้มีเพียง cluster เดียวใน genome ของ ~iS. platensis~i strain C1 คือพบ เฉพาะ บริเวณปลาย 3(+,ข) ของยีน ~idesA~i แสดงให้เห็นว่า DNA ชุดนี้มีความจำเพาะ ต่อยีนนี้ และอาจมีส่วนเกี่ยวข้องกับการทำงานของยีน

บรรณานุกรม :
สุทธิชา ณ ระนอง . (2544). การศึกษาผลของการดัดแปลงลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ปลาย 3(+,ข) ต่อเสถียรภาพ ของ mRNA ของยีน ~idesA~i จาก ~iSpirulina platensis~i strain C1.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
สุทธิชา ณ ระนอง . 2544. "การศึกษาผลของการดัดแปลงลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ปลาย 3(+,ข) ต่อเสถียรภาพ ของ mRNA ของยีน ~idesA~i จาก ~iSpirulina platensis~i strain C1".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
สุทธิชา ณ ระนอง . "การศึกษาผลของการดัดแปลงลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ปลาย 3(+,ข) ต่อเสถียรภาพ ของ mRNA ของยีน ~idesA~i จาก ~iSpirulina platensis~i strain C1."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2544. Print.
สุทธิชา ณ ระนอง . การศึกษาผลของการดัดแปลงลักษณะโครงสร้างทุติยภูมิที่ปลาย 3(+,ข) ต่อเสถียรภาพ ของ mRNA ของยีน ~idesA~i จาก ~iSpirulina platensis~i strain C1. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2544.