| ชื่อเรื่อง | : | การพัฒนาเครื่องหมาย DNA บริเวณ Simple Sequence Repeats (SSRs) เพื่อการจำแนกและทำมาตรฐานพันธุ์กล้วยไทย |
| นักวิจัย | : | จามร สมณะ |
| คำค้น | : | capillary fragment analysis , DNA polymorphisms , fluorescence probe , Molecular markers , multiplex PCR , Musa , Simple Sequence Repeats (SSRs) , พันธุ์กล้วย ปลูก , รูปแบบความหลากหลายของ DNA , เครื่องหมายโมเลกุล |
| หน่วยงาน | : | สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2556 |
| อ้างอิง | : | http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5380133 , http://research.trf.or.th/node/7569 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | กล้วย (Musa L) เป็นพืชเศรษฐกิจและแหล่งอาหารที่สำคัญในเขตร้อนและกึ่งร้อนของโลก การดูแลและปรับปรุงแหล่ง พันธุกรรมกล้วยเป็นสิ่งสำคัญในด้านความมั่นคงทางการผลิตอาหารและการใช้ประโยชน์ในรูปแบบอื่นๆ แต่ว่าการ จำแนกชนิดและพันธุ์กล้วยไม่แน่นอนและบางส่วนยังเป็นปัญหา โดยฉพาะในกลุ่มกล้วยปลูกทั้งนี้เพราะมีความ หลากหลายของแหล่งกำเนิดที่ซับซ้อนและไม่ทราบแน่ชัด ได้มีการค้นหาและตรวจสอบความหลากหลายของกล้วย บ้างแล้วแต่ก็ยังไม่ได้ความกระจ่าง และกล้วยในไทยมีส่วนร่วมด้วยน้อยมาก จากปัญหาเหล่านี้จึงจำเป็นต้องมีการใช้ เครื่องหมายทาง DNA ที่มีความละเอียดมากขึ้นเพื่อให้มีข้อมูลที่ชัดเจนขึ้นเพื่อการจัดการทรัพยากรทางพันธุกรรม Simple Sequence Repeats (SSRs) หรือ microsatellite DNA marker เป็นหนึ่งในเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่มี ความสามารถในการจำแนกสูงสุดไม่ใช่แค่พันธุ์หรือหรือสายพันธุ์กล้วยแต่ยังบอกสายต้นและความสัมพันธ์กับพ่อแม่ พันธุ์ต้นกำเนิดในลูกผสมได้ การพัฒนา microsatellite marker ในกล้วยไทยในการศึกษานี้ใช้ genomic DNA library ของ Musa balbisiana กล้วยตานีป่าตาดหลวง (BB genome) ซึ่งเพื่มความเข้มข้นในส่วนของเบสซ้ำ (CT)n, (GT)n, (AAC)n และ (GAA)n ด้วยการจับกับเม็ดแม่แหล็กแล้วเลือกประมาณ 100 โคลนที่มีชิ้น DNA เหล่านี้เพื่อสร้างอย่าง น้อย 50 microsatellite loci ในจำนวนนี้ 28 คู่ primer ที่ใช้ได้ดีนำมาทดสอบกับกล้วย 95 ตัวอย่างที่เป็นตัวแทนกล้วย ป่าชนิดต่างๆ และกล้วยปลูกจีโนม AA, AAA, AAB, ABB และ BBB ลายพิมพ์ DNAที่เกิดขึ้นจากแต่ละตัวอย่างจะ นำมาประเมินค่าความหลากหลายของรูปแบบเฉลี่ย (PIC) ค่าคาดการณ์ความหลากหลายเฉลี่ยของยีนต่อตำแหน่ง (Hi) จำนวนอัลลีลเฉลี่ยและความถี่อัลลีลต่อตำแหน่ง ซึ่งค่าที่ได้และรูปแบบสามารถนำมาใช้เป็นตัวอ้างอิงพันธุ์กล้วย สำหรับการจัดการทรัพยากรพันธุ์กล้วยทั้งในระดับประเทศและระดับโลก Banana (Musa L.) is an economically and nutritionally important tropical and subtropical food crops in many countries. Maintenance and improvement banana germplasm are important to ensure the safety for food crop production and other uses. However, identification of banana species and cultivars is not very precise and some still problematic. This usually happens especially in cultivars due to the origin and diversity of edible banana genetic backgrounds are not well known and rather complex. Banana biodiversity and genetic relationships have been evaluated with respect to many parameters but still not very decisive. Little contribution of studies has been done on characterization of Thai bananas. From these problems, it is important to employ more powerful DNA markers to clarify and utilize that knowledge to manage our genetic resources. Simple Sequence Repeats (SSRs) or microsatellite DNA markers are among the most powerful markers, not only to clarify banana samples in clone, variety or cultivar group levels but also able to identify parental relationship in hybrids. Development of microsatellite markers for Bananas in Thailand will be done by using genomic library of Musa balbisiana ‘Tani Pa Tadluang’ (BB genome), which will be enrich for (CT)n, (GT)n, (AAC)n and (GAA)n repeats using magnetic particles then clone and select. About 100 positive clones will be selected and designed for at least 50 of microsatellites loci. Of which, at least effective 28 primer pairs will be tested for about 95 represent Musa species and cultivars (AA, AAA, AAB, ABB, and BBB genome). The DNA fingerprint patterns form each sample will be evaluated for the average polymorphism information content (PIC) value, the average expected gene diversity per loci (Hi), the average numbers of allele and allele frequency of each loci in the test population of wild and cultivated bananas. Those values and fingerprinting patterns will be standardized and set as references for Thai bananas for further genetic resource management of the nation and worldwide. |
| บรรณานุกรม | : |
จามร สมณะ . (2556). การพัฒนาเครื่องหมาย DNA บริเวณ Simple Sequence Repeats (SSRs) เพื่อการจำแนกและทำมาตรฐานพันธุ์กล้วยไทย.
กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย. จามร สมณะ . 2556. "การพัฒนาเครื่องหมาย DNA บริเวณ Simple Sequence Repeats (SSRs) เพื่อการจำแนกและทำมาตรฐานพันธุ์กล้วยไทย".
กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย. จามร สมณะ . "การพัฒนาเครื่องหมาย DNA บริเวณ Simple Sequence Repeats (SSRs) เพื่อการจำแนกและทำมาตรฐานพันธุ์กล้วยไทย."
กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2556. Print. จามร สมณะ . การพัฒนาเครื่องหมาย DNA บริเวณ Simple Sequence Repeats (SSRs) เพื่อการจำแนกและทำมาตรฐานพันธุ์กล้วยไทย. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2556.
|
