ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการวิเคราะห์หาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุล Doritis

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการวิเคราะห์หาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุล Doritis
นักวิจัย : ชัชวาล จันทราสุริยารัตน์
คำค้น : Doritis , genetic diversity , microsatellite marker , transferability , การถ่ายโอนเครื่องหมาย , ความหลากหลายทาง พันธุกรรม , เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2556
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5380008 , http://research.trf.or.th/node/7517
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

“ม้าวิ่ง” เป็นกล้วยไม้ป่าที่มีถิ่นกำเนิดในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย โครงสร้างของดอกและ ความหลากหลายของสีดอก ทำให้กล้วยไม้ชนิดนี้มีศักยภาพสูงในการพัฒนาเพื่อเป็นไม้ตัดดอกในการ ส่งออก แต่การศึกษาและพัฒนาม้าวิ่งให้มีค่าทางเศรษฐกิจยังไม่มีมากนัก ดังนั้นการศึกษาครั้งนี้จึงได้ พัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST (Expressed Sequence Tag) จาก กล้วยไม้สกุลอื่นๆ เพื่อประโยชน์ในการใช้ปรับปรุงพันธุ์ของกล้วยไม้สกุลม้าวิ่ง โดยได้รวบรวม EST ของ กล้วยไม้ชนิดต่างๆ จากฐานข้อมูลจำนวน 8,009 EST จากนั้นค้นหาเครื่องหมายโมเลกุลไมโครแซทเทล ไลท์จากกลุ่มข้อมูลดังกล่าวได้จำนวนทั้งสิ้น 177 EST-SSR โดย 23 เครื่องหมาย EST-SSR และ 7 เครื่องหมาย EST จากจีโนมิกดีเอ็นเอ จาก Dendrobium และ Serapias ถูกนำมาใช้ศึกษาความ หลากหลายของกล้วยไม้ม้าวิ่ง ซึ่งผลจากการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอได้ 142 แอลลีล โดย 92 แอลลีล ที่แสดง ความแตกต่างภายในกลุ่มกล้วยไม้ม้าวิ่ง 30 ตัวอย่าง ค่าความหลากหลายที่คำนวณได้มีค่าเฉลี่ยเท่ากับ 0.6076 โดยอยู่ในช่วง 0.1244 ถึง 0.8439 เมื่อนำข้อมูลที่ได้มาสร้างต้นไม้แสดงความสัมพันธ์ทาง วิวัฒนาการด้วยโปรแกรม UPGMA พบว่าสามารถแยกตัวอย่างกล้วยไม้ออกได้เป็น 3 กลุ่มตัวอย่างซึ่ง สอดคล้องกับอนุกรมวิธานของกล้วยไม้ จากผลการทดลองนี้แสดงว่าเครื่องหมายดีเอ็นเอที่พัฒนาขึ้นนี้ สามารถนำมาใช้เพื่อจัดจำแนก อนุรักษ์ และค้ดเลือกพ่อแม่พันธุ์ในการปรับปรุงพันธุ์กล้วยไม้สกุลม้าวิ่งได้ Doritis is a wild terrestrial orchid, originated in the Northeastern part of Thailand. With its good floral structure and very diverse color, it has high potential to develop into commercial ornamental plant or to use as a hybridizer with other orchid species. Unfortunately it has not been studied in detail for its potential of development. In this study we developed SSR markers from EST database and examined the transferability of genomic SSR markers from other orchids in Doritis. 8009 ESTs belonged to family Orchidaceae were collected and analyzed for microsatellite. A total of 177 EST-SSR were identified. Twenty three EST-SSR and seven genomic SSR primers (from Dendrobium and Serapias) were used for genetic diversity assessment of Doritis germplasms. 142 alleles were generated in which, 92 alleles (64.8%) showed polymorphism among 30 Doritis accessions (Doritis regnieriana, Doritis pulcherrima and D. pulcherrima var. buyssoniana). The polymorphic information content (PIC) average at 0.6076 and ranged from 0.1244 to 0.8439. The phylogenetic tree based on UPGMA showed three major clades based on their taxonomy indicating that SSR markers developed in this study can be used for identification, conservation and selection of appropriate parents for the Doritis hybrid production in future.

บรรณานุกรม :
ชัชวาล จันทราสุริยารัตน์ . (2556). การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการวิเคราะห์หาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุล Doritis.
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
ชัชวาล จันทราสุริยารัตน์ . 2556. "การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการวิเคราะห์หาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุล Doritis".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
ชัชวาล จันทราสุริยารัตน์ . "การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการวิเคราะห์หาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุล Doritis."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2556. Print.
ชัชวาล จันทราสุริยารัตน์ . การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการวิเคราะห์หาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุล Doritis. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2556.