I funghi marini includono rappresentanti dei phyla Ascomycota, Basidiomycota. Zygomycota e funghi anamorfi per un totale di 530 specie (Jones et al., 2009). Quelli più frequentemente raccolti sono gli Ascomycota con circa 424 specie (251 generi), i funghi anamorfi contano 94 specie (61 generi) e solo 12 specie (9 generi) di Basidiomycota. I funghi sono un gruppo ecologico presente come saprobi, parassiti (sia di animali che di piante) ed endofiti (Jones et al., 2008). I funghi hanno una distribuzione mondiale, ma mentre alcuni taxa sono cosmopoliti, altri sono confinati ai tropici/sub tropici, zone temperate o di acque fredde (Artico ed Antarctico). La maggior parte degli studi sui funghi marini è sui saprobi coltivati su materiale ligneocellulosico, culmi di piante salmastre, foglie e rizomi di fanerogame, alghe piaggiate (Jones et al., 2009; Sakayaroj et al., 2010). Dei 530 funghi marini il maggior numero si trova ai tropici, anche se ciò è stato studiato comparativamente solo di recente. Alias & Jones (2010) riferiscono che dei 140 funghi delle mangrovie segnalati in Malesia, il 76% è conosciuto solo per i tropici.