การระบุสปีชีส์ของยีสต์ที่แยกจากข้าวหมาก และเครื่องดื่มที่มีแอลกอฮอล์ของไทยโดยการศึกษาลำดับเบสบริเวณ rDNA ในส่วนของ D1/D2 domain ที่อยู่บริเวณปลาย 5' ของยีน26S rRNA และส่วนของ ITS-5.8S rDNA พบว่ายีสต์ทุกไอโซเลทที่ทำการศึกษาให้ขนาดของผลผลิตPCR บริเวณ D1/D2 domain ประมาณ 600 bp แตกต่างจากขนาดของผลผลิต PCR บริเวณITS-5.8S rDNA จะให้ขนาดแตกต่างกันในแต่ละไอโซเลทซึ่งอยู่ในช่วงประมาณ 340-1040 bp ผลผลิต PCR ถูกนำมาหาลำดับเบสโดยวิธี direct sequencing และเปรียบเทียบลำดับเบสที่ได้กับฐานข้อมูล GenBank โดยใช้ Blast search tool ซึ่งสามารถระบุสปีชีส์ยีสต์จากตัวอย่างยีสต์ทั้งหมด 19 ไอโซเลท ได้แก่ยีสต์สปีชีส์ต่าง ๆ ดังต่อไปนี้ ~iCandida atlantica,C. colliculosa, C. guilliermondii, C. lusitaniae, C. tropicalis, Hanseniasporaosmophila, H. uvarum, H. vineae, Loderomyces elongisporus, Pichia anomala, Saccharomycescerevisiae~i และ ~iSaccharomycopsis fibuligera~i โดยผลการระบุสปีชีส์ดังกล่าวถูกนำมาเปรียบเทียบกับผลการระบุสปีชีส์โดยการทดสอบความสามารถในการใช้แหล่งคาร์บอน โดยใช้ชุดทดสอบAPI 20C AUX เปรียบเทียบลำดับเบสโดยโปรแกรม Clustal X คำนวณค่าความแตกต่างทางพันธุกรรมโดยวิธี Kimura 2-parameter และสร้าง phylogenetic tree โดยวิธี neighbor-joiningเพื่ออธิบายความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม พบว่า phylogenetic tree ที่ได้จากการศึกษาลำดับเบสทั้ง 2 บริเวณนั้นให้ผลที่สอดคล้องกัน การศึกษาลำดับเบสบริเวณ ITS-5.8S rDNA ถูกนำมาใช้ในการยืนยันผลการระบุสปีชีส์ของยีสต์ที่ผ่านการระบุสปีชีส์โดยวิธี conventional method จำนวน 50 ไอโซเลท ซึ่งประกอบด้วยยีสต์ที่แยกจากลูกแป้งเหล้า 11 ไอโซเลท ลูกแป้งข้าวหมาก 23 ไอโซเลท และจากศูนย์จุลินทรีย์สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งประเทศไทยจำนวน 16 ไอโซเลท ผลการระบุสปีชีส์โดยการศึกษาลำดับเบสบริเวณ ITS-5.8S rDNA ให้ผลแตกต่างจากผลการระบุเดิม 9 ไอโซเลทเนื่องจากข้อจำกัดในการระบุสปีชีส์โดยวิธี conventional method มักจะมีปัญหาในการระบุสปีชีส์ยีสต์ที่มีลักษณะทางฟีโนไทป์ที่คล้ายกัน อย่างไรก็ตามการระบุสปีชีส์โดย conventionalmethod ยังคงเป็นขั้นตอนสำคัญที่ควรจะทำการทดสอบ ร่วมกับการทดสอบในระดับโมเลกุล ซึ่งสามารถนำมาแก้ปัญหาข้อจำกัดในการระบุสปีชีส์โดย conventional method และเพื่อให้ผลการทดลองที่มีความถูกต้อง แม่นยำ และน่าเชื่อถือมากขึ้น