ทำการสร้างห้องสมุด cDNA จาก mRNA ของกุ้งปกติ และกุ้งที่ติดเชื้อ~iVibrio harveyi~i เพื่อแยกหายีนที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกันของกุ้งกุลาดำ(~iPenaeus monodon~i) โดยอาศัยเทคนิค Expressed Sequence Tags (ESTs)พบโคลนจากห้องสมุด cDNA ของกุ้งปกติ และของกุ้งติดเชื้อ จำนวน 1.4X10('6) และ2.5X10('5) โคลน ตามลำดับ จากนั้นทำการหาลำดับนิวคลีโอไทด์โดยการสุ่มเลือกโคลนจำนวน 615 โคลน จากห้องสมุด cDNA ของกุ้งปกติ และ 447 โคลน จากห้องสมุด cDNAของกุ้งติดเชื้อ นำผลที่ได้ไปเปรียบเทียบกับยีนที่รายงานแล้วใน GenBank โดยใช้โปรแกรมBlastn และ Blastx (NCBI Advanced Blast Search) พบว่า โคลนจำนวน 308 โคลน(50.1%) จากห้องสมุด cDNA ของกุ้งปกติ และ 215 โคลน (48.1%) จากห้องสมุดของกุ้งติดเชื้อมีลำดับนิวคลิโอไทด์คล้ายกับยีนที่มีรายงานแล้วใน GenBank โดยเป็นยีนที่แตกต่างกัน 288 ยีน ยีนในกลุ่มที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกันพบทั้งสิ้น 34 ชนิด ได้แก่ยีนในระบบโปรฟินอลออกซิเดส ยีนในระบบการแข็งตัวของเลือด ยีนของสารต้านจุลชีพตัวยับยั้งโปรติเอส และโปรตีนฮีสช็อค เป็นต้น ซึ่งยีนของสารต้านจุลชีพพบมากที่สุดโดยแอนตี้ไลโพพอลิแซคคาไรด์แฟคเตอร์ พบมากเมื่อกุ้งมีการติดเชื้อ นอกจากนี้ พบยีนที่ครบสมบูรณ์ของโปรตีน 6 ชนิด คือ แอนติไลโพพอลิแซคคาไรด์แฟคเตอร์ พีเนียดินตัวยับยั้งโปรติเอส ครัสติน โปรตีนฮีสช็อค 10 และ ไซโทโซลิกซุปเปอร์ออกไซด์ดีสมิวเทส จากการศึกษาการแสดงออกของยีนในระบบภูมิคุ้มกัน 8 ชนิด โดยใช้เทคนิคsemi-quantitative RT-PCR วัดระดับของ mRNA ในเลือดกุ้งปกติและติดเชื้อแบคทีเรียที่เวลา 3, 6, 12, 24 และ 48 ชั่วโมง ภายหลังการฉีดเชื้อแบคทีเรียวิบริโอ พบการเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญ (p<0.05) ของยีนแอนตี้ไลโพพอลิแซคคาไรด์แฟคเตอร์ โปรตีนฮีสช็อค 90 และ ไลโซไซม์ และการลดลงอย่างมีนัยสำคัญ (p<0.05) ของยีนพีเนียดินและครัสติน แต่ไม่พบการเปลี่ยนแปลงของยีนของตัวยับยั้งโปรติเอส โปรฟีนอลออกซิเดสและ โปรตีนฮีสช็อค 70