ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การศึกษาหน้าที่ของ Zinc Cluster โปรตีนที่ควบคุมการแสดงออกของยีนใน non-fermentable carbon metabolism

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การศึกษาหน้าที่ของ Zinc Cluster โปรตีนที่ควบคุมการแสดงออกของยีนใน non-fermentable carbon metabolism
นักวิจัย : นิษก์นิภา สุนทรกุล
คำค้น : Adr1 , Rds2 , Saccharomyces cerevisiae , Zinc cluster protein , การควบคุมการแสดงออกของยีน , แหล่งคาร์บอนที่ไม่ผ่านกระบวนการสันดาป
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2555
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5280184 , http://research.trf.or.th/node/6519
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

ยีนบางกลุ่มของยีสต์ Saccharomyces cerevisiae จะถูกเหนี่ยวนำให้มีการแสดงออกเพิ่มขึ้นหรือลดลงในสภาวะที่ปราศจากแหล่งคาร์บอนกลูโคส โดยยีนดังกล่าวมักมีความเกี่ยวข้องกับการใช้แหล่งคาร์บอนทางเลือก เช่น การใช้แหล่งคาร์บอนที่ไม่ผ่านกระบวนการสันดาป อาทิเช่น เอธานอล หรือ กลีเซอรอล ซึ่งการควบคุมการแสดงออกของยีนกลุ่มนี้อยู่ภายใต้การควบคุมของ Snf1 kinase ที่ทำหน้าที่ในการควบคุมการทำงานของตัวควบคุมพันธุกรรม Cat8 Sip4 และ Adr1 รวมถึงตัวควบคุมพันธุกรรม Rds2 ซึ่งพึ่งถูกค้นพบว่ามีหน้าที่เกี่ยวข้องกับการใช้แหล่งคาร์บอนทางเลือกเช่นกัน ในงานวิจัยนี้ทางคณะผู้วิจัยได้ทำการศึกษายีนเป้าหมายของ ตัวควบคุมพันธุกรรม Rds2 ในสภาวะที่กลีเซอรอลถูกใช้เป็นแหล่งคาร์บอนทางเลือกแทนกลูโคส ด้วยเทคนิค Genome-wide location analysis เพื่อระบุยีนเป้าหมายของ Rds2 เราพบว่า Rds2 จับกับโปรโมเตอร์ของยีนในกลุ่ม Gluconeogenesis กลุ่ม Glyoxylate shunt และกลุ่ม TCA cycle รวมถึงยีนที่ถอดรหัสให้องค์ประกอบของไมโตคอนเดรีย และยีนที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองต่อสภาวะเครียด และเป็นที่น่าสนใจว่า Rds2 ยังจับกับยีนที่ทำหน้าที่เป็นตัวควบคุมพันธุกรรม อาทิเช่น Sip4 Adr1 และ Hap4 นอกจากนี้ เรายังพบว่า Rds2และAdr1มีกลุ่มยีนเป้าหมายที่คล้ายคลึงกัน จึงได้นำเสนอโมเดลเพื่ออธิบายความสัมพันธ์ระหว่าง ตัวควบคุมพันธุกรรมในการควบคุมการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับใช้แหล่งคาร์บอนทางเลือก Following glucose exhaustion, the yeast Saccharomyces cerevisiae reprograms its gene expression for adaptation to use alternate carbon sources such as the nonfermentable compounds ethanol and glycerol. The master kinase Snf1 mediates this process by controlling the activity of various transcriptional regulators, including Cat8, Sip4 and Adr1. The zinc cluster Rds2 is recently identified as an additional player in this pathway. In this study, a genome-wide location analysis of Rds2 is performed with cells growing in the presence of glycerol. Our results reveals that Rds2 binds to promoters of genes involved in gluconeogenesis, the glyoxylate shunt, and the TCA cycle as well as those encoding mitochondrial components and participating in stress response. Interestingly, Rds2 also binds at the promoters of SIP4, ADR1 and HAP4. More importantly, we observed an extensive overlap between the bound targets of Rds2 and Adr1. As a result, we proposed a model to describe the complex interplay among transcriptional regulators of alternative carbon source utilization in this yeast species.

บรรณานุกรม :
นิษก์นิภา สุนทรกุล . (2555). การศึกษาหน้าที่ของ Zinc Cluster โปรตีนที่ควบคุมการแสดงออกของยีนใน non-fermentable carbon metabolism.
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
นิษก์นิภา สุนทรกุล . 2555. "การศึกษาหน้าที่ของ Zinc Cluster โปรตีนที่ควบคุมการแสดงออกของยีนใน non-fermentable carbon metabolism".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
นิษก์นิภา สุนทรกุล . "การศึกษาหน้าที่ของ Zinc Cluster โปรตีนที่ควบคุมการแสดงออกของยีนใน non-fermentable carbon metabolism."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2555. Print.
นิษก์นิภา สุนทรกุล . การศึกษาหน้าที่ของ Zinc Cluster โปรตีนที่ควบคุมการแสดงออกของยีนใน non-fermentable carbon metabolism. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2555.