ศึกษาจุลินทรีย์ในระบบทางเดินอาหารของกุ้งกุลาดำ 3 กลุ่มคือ กุ้งแข็งแรง กุ้งติดเชื้อแบคทีเรีย และไวรัส อย่างละ 13 ตัว พบว่าปริมาณแบคทีเรียทั้งหมดที่เจริญบนอาหาร Tryptic soy agar (TSA) และปริมาณเชื้อวิบริโอที่เจริญบนอาหาร TCBS แตกต่างอย่างไม่มีนัยสำคัญ (P<0.05) ระหว่างกุ้งทั้งสามกลุ่ม ทั้งนี้พบว่ากุ้งที่ติดเชื้อไวรัสมีปริมาณแบคทีเรียและวิบริโอทั้งหมดสูงกว่ากุ้งอีกสองกลุ่ม กล่าวคือมีปริมาณ 9.01 0.45 และ 6.56  0.06 log10 cfu/g ตามลำดับ ส่วนกุ้งติดเชื้อแบคทีเรียมีปริมาณ 8.80  0.30 และ 6.15  0.37 log10 cfu/g และกุ้งปกติมีปริมาณ 8.44  0.32 และ 6.36  0.37 log10 cfu/g ตามลำดับ บนอาหาร TSA พบแบคทีเรีย 8 ชนิด ที่พบสูงสุด 3 อันดับแรกคือ Micrococcus spp., Corynebacterium spp. และ Staphylococcus spp. ชนิดอื่น ๆ ที่พบได้แก่ คือ Bacillus spp., Enterobacter spp., E. coli, Flavobacterium spp. และ Vibrio spp. จากการเทียบเคียงเฉพาะกลุ่ม Vibrio spp. จากอาหาร TCBS พบทั้งหมด 15 สปีชีส์ ที่พบสูงสุด 3 อันดับแรกคือ V. cincinatiensis, V. vulnificus B2 และ V. carchariae ส่วนชนิดอื่น ๆ ที่พบได้แก่ คือ V. alginolyticus, V. cambellii, V. damsela, V. harveyi, V. logei, V. marinus, V. mediteranei, V. mimicus, V. natriegens, V. orientalis, V. pelagius I และ V. pelagius II ส่วนการศึกษาชนิดของแบคทีเรียแลคติกจากระบบทางเดินอาหารของกุ้งกุลาดำที่เจริญบนอาหาร MRS โดยอาศัยความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการพบว่าส่วนใหญ่เป็นเชื้อในกลุ่ม Enterococcus spp. เมื่อนำเชื้อที่แยกได้จากกุ้งกุลาดำไปทดสอบความสามารถในการยับยั้งเชื้อก่อโรคเรืองแสง V. harveyi พบว่ามีการยังยั้งจาก filamentous actinomycetes, lactic acid bacteria, Bacillus spp., และ V. alginolyticus แต่ไม่พบการยั้บยั้งจากยีสต์ จากการคัดเลือกจุลินทรีย์โปรไบโอติกด้วยการเลี้ยงกุ้งกุลาดำที่มีการเหนี่ยวนำให้เกิดโรคเรืองแสงด้วยอาหารที่ผสมเชื้อแบคทีเรียแลคติกและยีสต์พบว่ามีแบคทีเรียแลคติกจำนวน 4 สายพันธุ์ และยีสต์จำนวน 1 สายพันธุ์ ที่ทำให้กุ้งกุลาดำมีอัตราการรอดตายถึง100% การศึกษาในครั้งนี้ยืนยันได้ว่าระบบทางเดินอาหารของกุ้งกุลาดำมีเชื้อจุลินทรีย์ที่หลากหลาย อาศัยอยู่ร่วมกัน และการเสริมจุลินทรีย์โปรไบโอติกที่เป็นประโยชน์ลงในอาหารเลี้ยงกุ้งสามารถช่วยให้กุ้งมีชีวิตรอดจากการรุกรานของเชื้อก่อโรคได้ดี Microorganisms from digestive tracts of 3 groups of black tiger shrimps have been investigated from 13 each of healthy, bacterial and viral infected shrimps. The results showed that the total bacterial count TSA medium and the total vibrio count from TCBS medium were not significantly different (P<0.05) between the three groups of shrimps. However, the highest number of both groups was found from viral infected shrimps; 9.01 0.45 and 6.56  0.06 log10 cfu/g, respectively. While in bacterial infected and healthy shrimps were 8.80  0.30, 6.15  0.37 log10 cfu/g and 8.44  0.32, 6.36  0.37 log10 cfu/g, respectively. Eight genus of bacteria were found from the TSA medium; Bacillus spp., Corynebacterium spp., Enterobacter spp., E. coli, Flavobacterium spp., Micrococcus spp., Staphylococcus spp. and Vibrio spp. There were 15 species of vibrios isolated from the TCBS medium; V. cincinatiensis, V. vulnificus B2, V. carchariae, V. alginolyticus, V. cambellii, V. damsela, V. harveyi, V. logei, V. marinus, V. mediteranei, V. mimicus, V. natriegens, V. orientalis, V. pelagius I และ V. pelagius II. The phylogenetic tree based on 16S rDNA sequences showed that Enterococcus spp. was the dominant group of lactic acid bacteria in the digestive tracts of black tiger shrimps. Microorganisms isolated from black tiger shrimps were tested for inhibition activity against V. harveyi, the causative agent of luminous disease. The inhibition activity was found from actinomycetes, lactic acid bacteria, Bacillus spp. and V. alginolyticus but not from yeast. Selection of probiotic bacteria and yeast were conducted by mixing them with shrimp commercial feed for black tiger shrimps cultivation system. There were 4 and 1 isolates of lactic acid bacteria and yeast, respectively that shrimps could survive for 100% when V. harveyi was added for challenging. This study confirmed that there were diverse species of microflora occupied in digestive tracts of black tiger shrimps and supplemented shrimp feed with beneficial probiotics could help shrimps to survive well from invasion of harmful bacteria.