จากการดำเนินการของ สกว. ฝ่ายวิชาการ ทำให้เกิดการสนับสนุนการวิจัยในลักษณะเน้นทิศทางในการวิจัย โดยเริ่มจากโครงการเคมีทางยาเป็นโครงการแรก การดำเนินงานได้มีการจัดตั้งกลุ่มผู้ประสานงานเป็นคณะทำงาน ภายใต้การให้คำปรึกษาและแนะนำของนักวิจัยอาวุโสและเมธีวิจัยอาวุโส สกว. อย่างดียิ่ง จึงทำให้การดำเนินงานผ่านไปได้ด้วยดี และขณะนี้สามารถกำหนดกลุ่มวิจัยได้ห้ากลุ่มหลัก โดยมุ่งเน้นการศึกษาสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีฤทธิ์ต้านทานโรคที่มีความสำคัญต่อประเทศคือการวิจัยเน้นทิศทางด้าน สารต้านมะเร็ง สารต้านโรคติดเชื้อ สารต้านการอักเสบ สารต้านอนุมูลอิสระ และสารต้านไวรัส รวมทั้งมีกลุ่มวิจัยในลักษณะอื่น ๆ ด้วยโดยนักวิจัยกลุ่มนี้ส่วนใหญ่เป็นนักวิจัยรุ่นใหม่ ที่ต้องการศึกษาวิจัยและพัฒนาความเชี่ยวชาญเฉพาะทาง นอกจากนี้แล้วยังเกิดการสร้างเครือข่ายความร่วมมือเคมีทางยาระหว่างนักวิจัย มีการติดต่อผ่านโดยระบบอิเล็กทรอนิกส์ และจะได้สร้างฐานข้อมูลนักวิจัย รวมทั้งผลการวิจัยของโครงการวิจัยที่ได้รับการสนับสนุนในระยะต่อไป ทั้งนี้เพื่อให้ผู้ที่สนใจหรือเกี่ยวข้องกับโครงการเคมีทางยาที่ต้องการใช้ประโยชน์จากโครงการวิจัยเคมีทางยา สามารถติดต่อและใช้ประโยชน์ในการต่อไป โครงการเคมีทางยาได้มีการประสานงานกับฝ่ายประชาสัมพันธ์ของ สกว. และสื่อต่าง ๆ เพื่อเผยแพร่ผลการดำเนินงานวิจัยด้านเคมีทางยาแก่ประชาชนเป็นระยะ ๆ และนับไว้ว่าเป็นโครงการที่มีวัตถุประสงค์ตรงกับยุทธศาสตร์ของชาติ ที่ต้องการให้เกิดความร่วมมือในลักษณะของเครือข่าย และนำผลการวิจัยไปใช้ประโยชน์เพื่อการพัฒนาต่อประเทศต่อไป