| ชื่อเรื่อง | : | Comparison of DFT and ab initio QM/MM methods for modelling reaction in chorismate synthase |
| นักวิจัย | : | Lawan N. , Ranaghan K.E. , Manby F.R. , Mulholland A.J. |
| คำค้น | : | - |
| หน่วยงาน | : | มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ |
| ผู้ร่วมงาน | : | - |
| ปีพิมพ์ | : | 2557 |
| อ้างอิง | : | 00092614 , 10.1016/j.cplett.2014.06.010 , CHPLB , http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84903707057&partnerID=40&md5=5e4ddfa423529ab4b1c462e38a67ee48 , http://cmuir.cmu.ac.th/handle/6653943832/4888 |
| ที่มา | : | - |
| ความเชี่ยวชาญ | : | - |
| ความสัมพันธ์ | : | - |
| ขอบเขตของเนื้อหา | : | - |
| บทคัดย่อ/คำอธิบาย | : | Quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) methods are a popular tool in the investigation of enzyme reactions. Here, we compare B3LYP density functional theory (DFT) and ab initio QM/MM methods for modelling the conversion of 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate to chorismate in chorismate synthase. Good agreement with experimental data is only obtained at the SCS-MP2/CHARMM27 level for a reaction mechanism in which phosphate elimination precedes proton transfer. B3LYP predicts reaction energetics that are qualitatively wrong, stressing the need for ab initio QM/MM methods, and caution in interpretation of DFT results for this enzyme. © 2014 Elsevier B.V. All rights reserved. |
| บรรณานุกรม | : |
Lawan N. , Ranaghan K.E. , Manby F.R. , Mulholland A.J. . (2557). Comparison of DFT and ab initio QM/MM methods for modelling reaction in chorismate synthase.
เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ . Lawan N. , Ranaghan K.E. , Manby F.R. , Mulholland A.J. . 2557. "Comparison of DFT and ab initio QM/MM methods for modelling reaction in chorismate synthase".
เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ . Lawan N. , Ranaghan K.E. , Manby F.R. , Mulholland A.J. . "Comparison of DFT and ab initio QM/MM methods for modelling reaction in chorismate synthase."
เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ , 2557. Print. Lawan N. , Ranaghan K.E. , Manby F.R. , Mulholland A.J. . Comparison of DFT and ab initio QM/MM methods for modelling reaction in chorismate synthase. เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ; 2557.
|
